我院成立于1953年，是国家创建的首批工程勘察设计机构之一。经历了学习起步、独立自主、曲折前进的创立与成长的艰辛历程，从几十人的设计队伍发展到近千人，逐步成长为集设计、科研为一体，具有专业特色的国家级大型设计院。20多年来，完成了我国电子工业绝大部分工厂、学校和研究所的工程设计工作；积极开展电子工程建设的研究与开发，在洁净厂房、纯水处理、电磁屏蔽、防微振、非标准设备等方面取得一大批科研成果；承担了对朝鲜、越南、罗马尼亚等国家的近20个援外项目。随着国家部委的分合，我院的名称亦多次改变。1976年开始，对外称中国电子工程设计院。

在改革开放的大好形势下，我院步入发展壮大的新阶段，由单纯的事业单位逐步转变为能够承担大型工程建设项目，具有较强综合实力和竞争能力的科技型企业。1980年开始，承担了国内几乎全部彩管、玻壳的设计工作，为我国在短短十几年时间成为世界彩电大国做出了积极贡献。1984年，实行事业单位企业化管理，管理体制和运行机制进行了重大改革。在工程设计快速发展的同时，坚持一业为主，多种经营：纵向，以设计为主，向两头延伸；横向，从电子工业向航空航天、邮电通讯、生物医药、智能建筑、民用建筑等领域跨行业发展。1979年成立了深圳分院，随后在海南、上海、苏州、厦门、大连等地设立了直属和分支机构，项目遍布全国。

新世纪以来，我院积极适应市场变化，不断推进企业的改制与转型，大力开展技术创新、业务创新、管理创新、商业模式创新，形成了以设计为龙头的工程建设全过程、多方位、宽领域的服务系统，逐步成为创新型工业工程、民用建筑和节能环保及相关建设领域具有专业化、国际化的集成服务提供商和组织者。2000年，成为中央直接管理的十家大型勘察设计单位之一。2003年，由国务院国资委管理，同年完成业务重组、主业改制、辅业分离工作。2009年，整体并入国家开发投资集团有限公司。在持续扩展并保持工业工程、民用建筑领域优势地位的同时，积极开拓节能环保新能源业务并成为行业领先者，构建了集聚人才、自主技术研发和工程化应用的开放式创新平台。积极开拓海外市场，业务覆盖亚洲、非洲和美洲。我院将进一步完善科技创新与技术服务平台、构建工程管理平台，实现跨越式发展。